Di una chiesa ad Arsego si parla per la prima volta nel testamento di Galvan Marascotto del 7 marzo 1161. Ma già nel 1130 il Vescovo di Padova San Bellino ricorda la Villa Arsici che fin dal primo diffondersi del cristianesimo contava una fiorente vita religiosa e comunitaria. Da una decima papale del 1297, imposta ecclesiastica consueta per quei tempi sappiamo che si intitolava a San Lamberto. Con regolarità delle visite vescovili, a partire dal Quattrocento, si hanno notizie più ampie sulla vita della parrocchia, sulle opere e sulla struttura della chiesa. Nel 1454 Diotisalvi da Foligno, vicario del vescovo di Padova Dandolo, annota che la chiesa di Arsego accorpa anche la chiesa di Marsango e di Santa Maria di Non, e la cappella di San Giorgio delle Pertiche.